Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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