Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NME3Q13232 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NME3Q13232 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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