Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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NR1H3Q13133 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR1H3Q13133 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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