Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms