Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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