Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms