Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COX10Q12887 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms