Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms