Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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