Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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