Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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