Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms