Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLGA3Q08378 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms