Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLEQ07864 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms