Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms