Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms