Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4BQ07343 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4BQ07343 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms