Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBQ06643 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBQ06643 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms