Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms