Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CREMQ03060 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CREMQ03060 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CREMQ03060 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CREMQ03060 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CREMQ03060 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CREMQ03060 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CREMQ03060 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREMQ03060 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms