Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PLAC8-201ENST00000311507 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms