Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms