Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNAQ00169 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms