Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms