Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms