Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms