Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO4P61968 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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