Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SPCS3P61009 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPCS3P61009 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPCS3P61009 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPCS3P61009 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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