Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms