Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms