Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms