Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms