Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms