Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA4P51532 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA4P51532 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms