Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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