Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL1P50553 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms