Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTPAP49638 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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