Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4P46934 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms