Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB10P40306 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms