Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPAP38571 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPAP38571 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms