Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms