Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms