Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPS1P31327 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms