Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms