Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms