Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms