Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms