Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms