Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF3P18847 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF3P18847 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF3P18847 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF3P18847 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF3P18847 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF3P18847 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF3P18847 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF3P18847 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms