Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPI1P17947 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPI1P17947 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms